1992.gadā uz padomju laikā dibinātās Galvenās valsts arhīvu pārvaldes bāzes nodibināja Valsts arhīvu ģenerāldirekciju, kuras uzdevums bija pārraudzīt un vadīt valsts arhīvu sistēmas darbību. 2011.gadā valsts arhīvu sistēmu reorganizēja, visas esošās valsts arhīvu iestādes apvienoja Latvijas nacionālajā arhīvā kā tās struktūrvienības.